Die Flugeinsatzstelle Wr. Neustadt ist seit 2024 am Areal der Cobra in Dienst. Zuvor war die Flugeinsatzstelle in Wien Meidling untergebracht. Da das Gebäude in Wien bereits in die Jahre gekommen war, entschied man sich zu einem kompletten Neubau der Flugeinsatzstelle, sowie des Wartungsbetriebs. Am 10. September 2024 wurde der neue Stützpunkt nach dreijähriger Bauzeit, vom Innenminister feierlich eröffnet.

Am Standort Wr. Neustadt sind neben der Flugeinsatzstelle auch der eigene Wartungsbetrieb, sowie ein Teil der Flugschule untergebracht. Die theoretische Ausbildung zum Luftfahrzeugführer findet in den Schulungsräumen in Wr. Neustadt statt, ein Großteil der praktischen Übungseinheiten finden am Standort Bad Vöslau statt. Im Wartungsbetrieb können sämtliche von der Polizei betriebene Hubschraubermuster gewartet und überprüft werden. Ein vollständig verdunklungsfähiger Hangar bietet zudem die Möglichkeit, Nachtsichtsysteme zu überprüfen.

Der Flugeinsatzstelle Wr. Neustadt stehen zwei Einsatzmaschinen des Typs EC 135 zur Verfügung, davon. Die am Standort Meidling stationierte Einsatzmaschine (eine H135 P3) ist für den Bergrettungseinsatz ausgerüstet. Sie besitzt ein Doppellasthakensystem sowie diverses Bergematerial für Einsätze am Seil. Besetzt wird die Maschine mit einem Piloten sowie einem Flugretter, welcher bereits vor Ausbildung zum Flugretter die Polizei-Bergführerausbildung absolviert hat. Der Bergrettungshubschrauber „Libelle“ ist nur im Tagbetrieb bis ECET einsatzbereit. Die zweite Einsatzmaschine ist am Aussenstandort am Wien-Schwechat stationiert. Die H135 P2+ ist 24h Einsatzbereit und mit modernsten Nachtsichtgeräten sowie einem FLIR System ausgestattet.